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http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/1204| Title: | Diversidade de Begomovírus em mosca branca (Bemisia Tabaci) na Paraíba, Minas Gerais e Distrito Federal. |
| Other Titles: | Diversity of Beginoviruses in white fly (Bemisia Tabaci) in Paraíba, Minas Gerais and Federal District. Diversidad de begomovirus en mosca blanca (Bemisia Tabaci) en Paraíba, Minas Gerais y Distrito Federal. |
| ???metadata.dc.creator???: | COSTA, Larissa Cavalcante. |
| ???metadata.dc.contributor.advisor1???: | CAMPOS, Magnólia de Araújo. |
| ???metadata.dc.contributor.advisor2???: | RIBEIRO, Simone da Graça. |
| ???metadata.dc.contributor.referee1???: | CAMPOS, Magnólia de Araújo. |
| ???metadata.dc.contributor.referee2???: | RIBEIRO, Simone da Graça. |
| ???metadata.dc.contributor.referee3???: | COSTA, Danielly Albuquerque da. |
| ???metadata.dc.contributor.referee4???: | LOPES, Marcus José Conceição. |
| ???metadata.dc.contributor.referee5???: | NASCIMENTO, Luciana Cordeiro do. |
| Keywords: | Geminiviridae;Amplificação por Círculo Rolante;DNA-A de begomovírus;Rolling Circle Amplification;Begomovirus DNA-A;Diversidade de Begonovíros;Mosca branca;Bemisia tabaci;Amplificación del círculo rodante;Mosca blanca |
| Issue Date: | 31-Jul-2015 |
| Publisher: | Universidade Federal de Campina Grande |
| Citation: | COSTA, Larissa Cavalcante. Diversidade de Begomovírus em mosca branca (Bemisia tobaci) na Paraíba, Minas Gerais e Distrito Federal. 2015. 80 fl. (Dissertação de Mestrado em Ciências Naturais e Biotecnologia), Programa de Pós-graduação em Ciências Naturais e Biotecnologia, Centro de Educação e Saúde, Universidade Federal Campina Grande - Cuité - Paraíba - Brasil, 2015. |
| ???metadata.dc.description.resumo???: | O gênero Begomovirus pertence à família Geminiviridae de vírus que infectam plantas e são transmitidos pelo vetor mosca branca (Bemisia tabaci), também considerado umas das maiores pragas da agricultura. O presente estudo investigou a diversidade de begomovírus presente no vetor mosca branca (B. tabaci) em áreas da Paraíba, Minas Gerais e Distrito Federal. Um total de 17 amostras de moscas brancas foi coletado a partir de 12 espécies vegetaisem áreas da Paraíba, Minas Gerais e Distrito Federal e e usado para detecção do DNA-A de begomovirus por PCR, por RCA e por PCR-RCA, com primers específicos. Amplicons virais foram clonados e os clones recombinantes foram selecionados sob meio de cultura seletivo, contendo X-Gal e IPTG. A presença de amplicons foi confirmada por padrões de restrição gerados pelas enzimas EcoR I e Msp I em DNAs plasmidiais isolados dos clones selecionados e, então, sequenciados. As sequencias de DNA-A de begomovírus isoladas de moscas brancas coletadas em plantas de algodoeiro EMEPA-PB, em Emília, picão preto, barba-de-falcão, jatrofa, berinjela e malvona, presentes na área do Distrito Federal, foram analisadas quanto a porcentagem de identidade de sequencias de nucleotídeos e agrupamentos filogenéticos comparando com outras sequencias de isolados de begomovírus disponíveis no banco de dados GenBank. Como resultado, 5 espécies de begomovírus (SiYBV, CoMoV, SiMMV, BGMV e SiGLSV) evidenciaram a diversidade de begomovírus presente em moscas brancas nas áreas estudadas, mas que não necessariamente está presente nas respectivas plantas onde as moscas foram coletadas. Os primers PAL1v 1978 e PAR1c 496 descritos para detecção de DNA-A de begomovírus a partir de plantas foram eficientes para detecção específica desse componente genômico viral a partir do vetor mosca branca. A detecção específica de DNA-A do componente de begomovírus por PCR a partir do DNA total extraído de moscas brancas foi enriquecida pela amplificação por RCA. O begomovírus BGMV foi predominantemente encontrado em moscas brancas coletadas em plantas na área do Distrito Federal. A diversidade presente nos isolados dos 5 vírus identificados neste trabalho foi agrupada em 4 ramos filogenéticos suportados pela porcentagem de identidade de sequencias de nucleotídeos comparadas com sequencias dos isolados de begomovírus disponíveis no banco de dados GenBank. |
| Abstract: | The Begomovirus genus belongs to Geminiviridae family of viruses that infect plants and is transmitted by whitefly (Bemisia tabaci) vector, which is also considered one of the major pests of agriculture. The present study investigated the diversity of begomovirusesin the whitefly vector (B. tabaci) in areas of Paraíba, Minas Gerais and the Federal District. A total of 17 samples of whiteflies were collected from 12 plant species in areas of Paraíba, Minas Gerais and the Federal District and used for the detection of begomovirus DNA-A by PCR, RCA and RCA-PCR with specific primers. Viral amplicons were cloned and the recombinant clones were selected on selective medium containing X-Gal and IPTG. The presence of amplicons was confirmed by restriction enzyme patterns generated by EcoR I and Msp I on plasmid DNAs of selected clones isolated and then sequenced. The begomovirus DNA-A sequences isolated from whiteflies collected from cotton plants EMEPA-PB, in Emilia, black prick, beard-of-hawk, jatropha, eggplant and malvona present in the Federal District, were analyzed bynucleotide sequence identity percentage and phylogenetic groups compared to other begomovirus strain sequences available in GenBank database. As a result, five species of begomovirus (SiYBV, CoMoV, SiMMV, BGMV e SiGLSV) revealed the diversity of begomovirus present in whiteflies in the studied areas, but that is not necessarily present in the respective plants where the flies were collected. The PAL1v 1978 PAR1c 496 primers described for begomovírus DNA-A detection from plants were also efficient for detection of this specific viral genomic component from whitefly vector. The specific detection of begomovirus DNA-A component by PCR from total DNA extracted from whiteflies was enriched by amplification by RCA. The BGMV begomovirus was found predominantly in whiteflies on plants collected in the Federal District. The diversity present in strains of thefive virus identified in this work was grouped into four phylogenetic branches supported by the nucleotide sequence identity percentage compared to sequences of the begomovirus strains available in GenBank database. |
| ???metadata.dc.description.resumen???: | El género Begomovirus pertenece a la familia de virus Geminiviridae que infectan las plantas y son transmitidos por el vector de la mosca blanca (Bemisia tabaci), también considerada una de las mayores plagas de la agricultura. El presente estudio investigó la diversidad de begomovirus presentes en el vector de la mosca blanca (B. tabaci) en áreas de Paraíba, Minas Gerais y Distrito Federal. Se recolectaron un total de 17 muestras de moscas blancas de 12 especies de plantas en áreas de Paraíba, Minas Gerais y Distrito Federal y se utilizaron para la detección de begomovirus DNA-A por PCR, por RCA y por PCR-RCA, con cebadores específicos. Los amplicones virales se clonaron y los clones recombinantes se seleccionaron en un medio de cultivo selectivo que contenía X-Gal e IPTG. La presencia de amplicones fue confirmada por patrones de restricción generados por las enzimas EcoR I y Msp I en plásmidos de ADN aislados de clones seleccionados y luego secuenciados. Se analizaron secuencias de ADN-A de begomovirus aislados de moscas blancas colectadas en plantas de algodón EMEPA-PB, en Emília, piqueta negra, barba de halcón, jatropha, berenjena y malvona, presentes en el área del Distrito Federal, para porcentaje de identidad de secuencias de nucleótidos y grupos filogenéticos en comparación con otras secuencias de aislamientos de begomovirus disponibles en la base de datos GenBank. Como resultado, 5 especies de begomovirus (SiYBV, CoMoV, SiMMV, BGMV y SiGLSV) mostraron la diversidad de begomovirus presentes en las moscas blancas en las áreas estudiadas, pero no necesariamente presentes en las respectivas plantas donde se recolectaron las moscas. Los cebadores PAL1v 1978 y PAR1c 496 descritos para la detección de begomovirus DNA-A de plantas fueron eficientes para la detección específica de este componente genómico viral del vector de mosca blanca. La detección específica de ADN-A del componente begomovirus por PCR a partir de ADN total extraído de moscas blancas se enriqueció mediante amplificación RCA. El begomovirus BGMV se encontró predominantemente en moscas blancas recolectadas de plantas en el área del Distrito Federal. La diversidad presente en los aislamientos de los 5 virus identificados en este trabajo se agrupó en 4 ramas filogenéticas respaldadas por el porcentaje de identidad de secuencia de nucleótidos en comparación con las secuencias de los aislamientos de begomovirus disponibles en la base de datos GenBank. |
| Keywords: | Geminiviridae Amplificação por Círculo Rolante DNA-A de begomovírus Rolling Circle Amplification Begomovirus DNA-A Diversidade de Begonovíros Mosca branca Bemisia tabaci Amplificación del círculo rodante Mosca blanca |
| ???metadata.dc.subject.cnpq???: | CIÊNCIAS BIOLÓGICAS; MICROBIOLOGIA |
| URI: | http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/1204 |
| Appears in Collections: | Mestrado em Ciências Naturais e Biotecnologia - Dissertações 001 |
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| LARISSA CAVALCANTE COSTA - DISSERTAÇÃO PPGCNBio CES 2015.pdf | Larissa Cavalcante Costa - Dissertação PPGCNBio CES 2015 | 1.28 MB | Adobe PDF | View/Open |
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