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Title: Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.
Other Titles: Identification and characterization of Aquaporines genes in Cnidoscolus quercifolius Pohl.
???metadata.dc.creator???: NÓBREGA, Gisela Formiga Queiroz.
???metadata.dc.contributor.advisor1???: SOARES, Carlos Eduardo Alves.
???metadata.dc.contributor.referee1???: BEZERRA NETO, João Pacífico.
???metadata.dc.contributor.referee2???: BAKKE, Ivonete Alves.
Keywords: Cnidoscolus quercifolius Pohl;Genes de Aquaporinas;Bioinformática;Euphobiaceas;Transportadores de membrana;Bioma Caatinga;Recursos genéticos vegetais - caatinga;Família Euphorbiaceae;Relações hídricas - plantas;Aquaporinas vegetais;Subfamílias de aquaporinas - plantas superiores;Ferramentas computacionais - análise de genes;Caracterização de sequências - Bioinformática;Modelagem comparativa;Extração de DNA;Extração de RNA;Aquaporin Genes;Bioinformatics;Membrane conveyors;Water relations - plants;Vegetable aquaporins;Aquaporin subfamilies - higher plants;Sequence characterization - Bioinformatics
Issue Date: 28-Mar-2017
Publisher: Universidade Federal de Campina Grande
Citation: Nóbrega, Gisela Formiga Queiroz. Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl. 2017. 106f. (Dissertação de Mestrado em Ciências Florestais), Programa de Pós-graduação em Ciências Florestais, Centro de Saúde e Tecnologia Rural, Universidade Federal de Campina Grande – Campus de Patos – Paraíba Brasil, 2017.
???metadata.dc.description.resumo???: A família botânica Euphorbiaceae Juss. é uma das mais diversificadas e complexas, apresentando cerca de 50 gêneros e 240 espécies no Nordeste brasileiro, grande parte distribuídos em áreas de Caatinga. Dentre essas, destacam-se Manihot esculenta Cartz, Ricinus communis L. e Cnidoscolus quercifolius Pohl, que, devido à tolerância ao déficit hídrico, apresentam-se como espécies de importância econômica para regiões tropicais, especialmente o Brasil. C. quercifolius é uma espécie endêmica da Caatinga, sendo bastante explorada devido às várias possibilidades de utilização de suas partes (produção de forragem, óleo comestível e farinha, utilizada na regeneração de áreas degradadas e para fins medicinais). Entre os mecanismos de adaptação às condições ambientais limitantes existentes em plantas superiores, ressalta-se a importância do reajuste dos padrões de expressão gênica, que atua ativando e desativando uma variedade de genes, considerados genes estresseresponsivos, que são responsáveis pelas alterações do metabolismo celular que permite à planta a geração de respostas fisiológicas frente à exposição ao estresse. Um exemplo são as aquaporinas vegetais, que são proteínas de membrana responsáveis pelo transporte de água, gases e outros pequenos solutos e que desempenham um papel fundamental na adaptação das plantas mediante estresses como salinidade e déficit hídrico. A identificação de genes estresse-responsivos só foi possível devido às novas tecnologias de sequenciamento e às ferramentas de bioinformática, que possibilitaram, não apenas a obtenção de genomas completos, como também a manipulação e análise desses dados, facilitando a identificação de novas moléculas envolvidas em processos fisiológicos essenciais às plantas. Até o momento, não se encontra disponível em bancos de dados biológicos qualquer tipo de informação genética de C. quercifolius. A identificação de aquaporinas em C. quercifolius foi realizada pelo processo de transferabilidade de iniciadores entre espécies próximas, tendo em vista a elevada conservação entre as sequências desta família gênica. Foram identificadas sete sequências parciais de CqAQPs, sendo este o primeiro relato de aquaporinas nesta espécie, podendo, assim, ser usado para o desenho de iniciadores específicos para a espécie, favorecendo a identificação de potenciais alvos biotecnológicos.
Abstract: Euphorbiaceae Juss. is one of the most diversified and complex species of the botanical family, comprising approximately 50 genera and 240 kinds in the Brazilian Northeast, widely distributed in Caatinga areas. Among them are Manihot esculenta Cartz, Ricinus communis L. and Cnidoscolus quercifolius Pohl, which, due to its tolerance to water shortage, are species of great economic importance for tropical regions, including Brazil. C. quercifolius is an endemic species of the Caatinga, and it has been extensively exploited for various uses (forage production, edible oil and flour, use in the regeneration of degraded areas and for medicinal purposes). Among the mechanisms of adaptation to the limiting environmental conditions existing in higher plants, we emphasize the importance of the readjustment of genetic gender patterns, which activates and deactivates a variety of genes that are considered genes-responsive genes responsible for cellular metabolism, which allows a generation of physiological responses to a plant from stress. An example of that are the aquaporins plants, which are membrane proteins responsible for transporting of water, gases and other small solutes, in addition to playing a key role in the adaptation of plants to adverse conditions such as salinity and water shortage. The identification of stress-responsive genes was only possible from new sequencing technologies and bioinformatics tools, which enabled not only the attainment of a complete genome, but also the manipulation and analysis of such data, facilitating the identification of new molecules involved in essential physiological processes to plants. To date, it is not available in biological databases any genetic information on C. quercifolius. The identification of aquaporins in C. quercifolius was conducted by the process of transferability of initiators between close species, considering the high conservation among the sequences of this family. Seven partial sequences of CQAQPs were identified, and this is the first report of aquaporins in that species; therefore, enabling its use for designing of specific initiators for the species, aiding the identification of potential biotechnological targets.
Keywords: Cnidoscolus quercifolius Pohl
Genes de Aquaporinas
Bioinformática
Euphobiaceas
Transportadores de membrana
Bioma Caatinga
Recursos genéticos vegetais - caatinga
Família Euphorbiaceae
Relações hídricas - plantas
Aquaporinas vegetais
Subfamílias de aquaporinas - plantas superiores
Ferramentas computacionais - análise de genes
Caracterização de sequências - Bioinformática
Modelagem comparativa
Extração de DNA
Extração de RNA
Aquaporin Genes
Bioinformatics
Membrane conveyors
Water relations - plants
Vegetable aquaporins
Aquaporin subfamilies - higher plants
Sequence characterization - Bioinformatics
???metadata.dc.subject.cnpq???: Ciências Florestais.
URI: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/15677
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