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http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/19007| Title: | Identificação e caracterização molecular de efetores do tipo CRN (Crinkling and necrosis-inducing protein) de phytophthora nicotianae de citros. |
| Other Titles: | Identification and molecular characterization of CRN (Crinkling and necrosis-inducing protein) effectors of citrus phytophthora nicotianae. Identificación y caracterización molecular de efectores tipo CRN (proteína inductora de arrugas y necrosis) de cítricos phytophthora nicotianae. |
| ???metadata.dc.creator???: | MEDEIROS, Gláucia Diojânia Azevêdo. |
| ???metadata.dc.contributor.advisor1???: | CAMPOS, Magnólia de Araújo. |
| ???metadata.dc.contributor.referee1???: | QUEIROZ, Jean César Farias de. |
| ???metadata.dc.contributor.referee2???: | RÊGO, Thaís Gaudencio do. |
| Keywords: | Gomose;Oomiceto;Patógeno;CitEST;Bioinformática;Gummosis;Oomycete;Pathogen;Bioinformatics;Gomosis;Gomosis |
| Issue Date: | 3-Dec-2010 |
| Publisher: | Universidade Federal de Campina Grande |
| Citation: | MEDEIROS, Gláucia Diojânia Azevêdo. Identificação e caracterização molecular de efetores do tipo CRN (Crinkling and necrosis-inducing protein) de phytophthora nicotianae de citros. 2010. 50 fl. (Trabalho de Conclusão de Curso – Monografia), Curso de Licenciatura em Ciências Biológicas, Centro de Educação e Saúde, Universidade Federal de Campina Grande, Cuité – Paraíba – Brasil, 2010. |
| ???metadata.dc.description.resumo???: | Phytophthora nicotianae var. parasitica é um oomiceto agente causador da gomose (ou podridão-do—pé) dos Citros, uma das mais importantes doenças que afetam a Citricultura brasileira. Patógenos desse gênero, incluindo P. parasítíca, possuem moléculas efetoras típicas que estabelecem uma interação com a planta, modulando a resposta de defesa: capacitando o parasitismo ou ativando a resistência, levando a morte celular programada. Dentre estas merecem destaque efetores do tipo CRN (Qrinkling Necrosís-[nducíng and Protein), os quais são efetores citoplasmáticos que causam fenótipos em plantas de enrugamento foliar e morte celular. O conhecimento da estrutura e função dos efetores de patógenos e os danos que eles causam nas plantas possibilitarão novas estratégias para a manipulação de plantas, levando-as à resistência a patógenos oomicetos. Neste contexto, o objetivo principal deste trabalho foi identificar e caracterizar efetores do tipo CRN de P. parasitica, usando ferramentas de Bioinformática para selecionar dentro do banco de dados de sequências expressas de P. parasitíca — o CitEST/PP, induzidas pelo crescimento in vitro após 40 ciclos de subcultivos e in planta após interação citros-P. parasitica. Como resultado, seis ESTs codificando possiveis efetores do tipo CRN em P. parasitica foram selecionados no banco de dados CitEST/PP, os quais foram agrupados em 2 contigs e 2 singlets que compartilham elevada similaridade de sequencia de aminoácidos com CRN proteínas de Phytophthora ínfestans. Este é o primeiro relato da caracterização da estrutura de genes do tipo CRN de P. nícotiana de citros. Os quatro genes do tipo CRN expressos em P. parasitíca foram encontrados induzidos durante interação com citros. Apesar de todos apresentarem sequências parciais, as sequências de aminoácidos deduzidas dos quatro genes apresentam região N—terminal conservada e bem caracterizada e região C—terminal muito diversificada e diferente das conhecidas até o momento. Os possíveis efetores do tipo CRN estudados são parte do secretoma de Phytophthora nicotíanae de citros, estudos futuros contribuirão para a clonagem, completa caracterização da estrutura de genes CRNs de P. nicotianae de citros, bem como sua caracterização funcional. |
| Abstract: | Phytophthora nícotíanae var. parasítíca is an oomiceto causal agente of gummosis (or foot rot) in citrus plants, one of most important diseases affecting the Brazilien Citriculture. Pathogens from this genus, including P. parasitíca, secrete typical effector molecules to establish an interaction with the host plant, moduling the defense response by either enabling the parasitism or activating the resistance mechanisms, leading to programmed cellular death (PDC). Among these, cytoplasm effectors such as crinkler (CRN, _Çrínklíng Necrosís- Inducíng and Protein) possessing predicted secretion signals and conserved N-terminal sequence motifs cause leaf crinkling and PDC phenotypes. The understanding of structure and functions of pathogen effectors as well loses caused by them in plants will to contribute to novel strategies for manipulation of plants, leading to resistance to oomicete pathogens. ln this context, the main objective of this work was to identify and to characterize CRN—like effectors from P. parasitíca, by using Bioinformatic tools to search within the CitEST/PP database expressed sequences induced by the in vitro growth, after 40 subculture cycles, and citrus— P. parasitíca interaction. As results, six ESTs encoding putative CRN-like effectors in P. parasitica were selected from CitEST/PP database. These ESTs were grouped into two contigs and two singlets, which share high amino acid sequences similarity with CRN genes from Phytophthora ínfestans. This is the first report on characterization of CRN-like genes of P. parasitíca. The four genes were found induced by the citrus interaction. Besides of genes showed partial sequences, the amino acid deduced sequences from them possess conserved N- termini and diverse C—terminal that are different of others described at the present. The studied putative CRN-like effectors may be part of P. parasitíca secretome and future works will be contribute to cloning, complete characterization of the CRN-like gene structures and functional roles. |
| ???metadata.dc.description.resumen???: | Phytophthora nicotianae var. parasitica es un oomiceto que causa gomosis (o pietín) en cítricos, una de las enfermedades más importantes que afectan a la citricultura brasileña. Los patógenos de este género, entre ellos P. parasítica, tienen moléculas efectoras típicas que establecen una interacción con la planta, modulando la respuesta de defensa: posibilitando el parasitismo o activando la resistencia, dando lugar a la muerte celular programada. Entre estos, merecen ser destacados los efectores del tipo CRN (Qrinkling Necrosis-[nducing and Protein), que son efectores citoplasmáticos que provocan fenotipos de arrugamiento de las hojas y muerte celular en las plantas. El conocimiento de la estructura y función de los efectores de patógenos y el daño que causan a las plantas permitirá nuevas estrategias para el manejo de las plantas, llevándolas a la resistencia a los patógenos oomicetos. En este contexto, el objetivo principal de este trabajo fue identificar y caracterizar efectores tipo CRN de P. parasitica, utilizando herramientas bioinformáticas para seleccionar dentro de la base de datos de secuencias expresadas de P. parasitica — CitEST/PP, inducidas por crecimiento in vitro después de 40 ciclos de subcultivos y en planta después de la interacción cítrico-P. parásito. Como resultado, se seleccionaron seis EST que codifican posibles efectores similares a CRN en P. parasitica de la base de datos CitEST/PP, que se agruparon en 2 contigs y 2 singletes que comparten una gran similitud de secuencia de aminoácidos con proteínas CRN de Phytophthora infestans. Este es el primer informe sobre la caracterización de la estructura de genes similares a CRN en P. nicotana de cítricos. Se descubrió que los cuatro genes similares a CRN expresados en P. parasitica se inducen durante la interacción con los cítricos. Aunque todos ellos presentan secuencias parciales, las secuencias de aminoácidos deducidas de los cuatro genes tienen una región N-terminal conservada y bien caracterizada y una región C-terminal muy diversa y diferente a las conocidas hasta el momento. Los posibles efectores tipo CRN estudiados forman parte del secretoma de los cítricos Phytophthora nicotianae, futuros estudios contribuirán a la clonación, caracterización completa de la estructura del gen CRN de los cítricos P. nicotianae, así como su caracterización funcional. |
| Keywords: | Gomose Oomiceto Patógeno CitEST Bioinformática Gummosis Oomycete Pathogen Bioinformatics Gomosis Gomosis |
| ???metadata.dc.subject.cnpq???: | Biologia |
| URI: | http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/19007 |
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