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http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/19011| Title: | Identificação de marcadores moleculares do tipo trap (traget region amplification polymorphism) em híbridos de Poncirus Trifoliata e Citrus Sunki. |
| Other Titles: | Identification of trap-type molecular markers (traget region amplification polymorphism) in Poncirus Trifoliata and Citrus Sunki hybrids. Identificación de marcadores moleculares tipo trampa (polimorfismo de amplificación de región objetivo) en híbridos de Poncirus Trifoliata y Citrus Sunki. |
| ???metadata.dc.creator???: | SANTOS, Jonathas Diego Lima. |
| ???metadata.dc.contributor.advisor1???: | CAMPOS, Magnólia de Araújo. |
| ???metadata.dc.contributor.referee1???: | LOPES, Marcus José Conceição. |
| ???metadata.dc.contributor.referee2???: | MEDEIROS, Flavio Henrique Vasconcelos. |
| Keywords: | Citros;PCR;CitEST;Marcadores moleculares;Marcadores moleculares;Citrus;Molecular markers;Citrus breeding;Agrios |
| Issue Date: | 2010 |
| Publisher: | Universidade Federal de Campina Grande |
| Citation: | SANTOS, Jonathas Diego Lima. Identificação de marcadores moleculares do tipo trap (traget region amplification polymorphism) em híbridos de Poncirus Trifoliata e Citrus Sunki. 2010. 37 fl. (Trabalho de Conclusão de Curso – Monografia), Curso de Licenciatura em Ciências Biológicas, Centro de Educação e Saúde, Universidade Federal de Campina Grande, Cuité – Paraíba – Brasil, 2010. |
| ???metadata.dc.description.resumo???: | A citricultura brasileira enfrenta sérios problemas e perdas devido ao grande número de doenças causadas por patógenos. Considerando—se que a resistência genética e' um importante componente de estratégias integradas para controlar doenças em plantas, por ser eficiente, baixo custo para o produtor, benéfica ao homem e ao meio ambiente, programas de melhoramento dos citros buscam aumentar a produtividade pelo uso de estratégias genéticas de controle de doenças. Durante o desenvolvimento de novas variedades, melhoristas têm incorporado a seleção assistida por marcadores, na detecção de genes que estejam associados com a resistência a doença. Um novo e eficiente sistema de marcadores moleculares, o TRAP (Target Region Amplificatíon Polymorphism), baseado em PCR, usa ferramentas de bioinformática e informações de banco de dados de ESTS para gerar marcadores polimórfrcos ao redor de possíveis seqftências de genes candidatos. Neste sentido, o maior banco de dados de genoma expresso dos citros do mundo, o CitEST, gerado no Brasil, representa uma poderosa ferramenta para auxiliar o programa de melhoramento dos citros, uma vez que possui genes expressos de todas as espécies consideradas citros (] 1 espécies) sob genótipos e condições contrastantes, tais como resistente versus suscetível, induzido versus não induzido por patógenos. Neste contexto, este trabalho descreve a identificação de marcadores TRAPs amplificados por primers fixos, desenhados & partir de genes associados com a resistência a CTV (vírus da tristeza dos citros), usando DNAs de indivíduos da progênie F 1 do cruzamento de Poncirus trifolíata com Tangerina Sunki (Citrus sunkz'), parentais resistente e suscetível a doenças, respectivamente. De um total de 8 combinações de “primers” abritrárío/tixos testadas, 2 combinações apresentaram polimorfismo, gerando um total de 4 marcas e um número médio de marcadores por par de “primer” no valor de 2. O teste de Qui—quadrado, aplicado individualmente aos marcadores TRAPS, revelou que 100% dos marcadores identificados segregam na proporção Mendeliana lzl. Portanto, estes marcadores poderão ser introduzidos no mapa de ligação de P. tríjblíata. Os marcadores obtidos poderão ainda ser usados na genotipagem de todos os indivíduos da referida população Fl. |
| Abstract: | The Brazilian citrus industry faces serious problems and losses due to the large number of diseases caused by pathogens. Considering that the genetic resistance is an important component of integrated strategies to control plant diseases, because it is efficient, low cost to the producer, beneficia] to man and the environment, the citrus breeding programs seek to increase productivity by using genetic strategies for disease control. Durante o desenvolvimento de novas variedades, melhoristas têm incorporado a seleção assistida por marcadores, na detecção de genes que estejam associados com a resistência a doença. A new and efficient system of molecular markers, TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) based on PCR, using bioinformatics tools and information database of ESTs to generate polymorphic markers around the possible sequences of candidate genes. In this sense, the largest database of expressed genome of citrus in the world, CitEST generated in Brazil, represents & powerful tool to help the citrus breeding program, since it has all the genes expressed in citrus species considered (ll species) and genotypes under contrasting conditions, such as resistant versus susceptible induced versus not induced by pathogens. In this context, this paper describes the identification of markers amplified by primers TRAPS fixed, designed from genes associated with resistance to CTV (citrus tristeza virus), using DNA from individuals of the Fl progeny from the crossing of Poncirus trifoliata with Sunki (Citrus sunki), parental susceptible and resistant to disease, respectively. Of a total of 08 combinations of primers abritrário / fixed tested 02 combinations showed polymorphism, generating a total of 04 marks and an average number of markers per pair of primer on the value of 2. The Chi—square applied to individual markers traps, revealed that 100% of the identified markers segregate in Mendelian lzl ratio. Therefore, these markers may be placed on the linkage map of P. trifoliata. These markers may also be used in the genotyping of all individuals of that population Fl. |
| ???metadata.dc.description.resumen???: | La citricultura brasileña enfrenta serios problemas y pérdidas debido a la gran cantidad de enfermedades causadas por patógenos. Teniendo en cuenta que la resistencia genética es un componente importante de las estrategias integradas para el control de enfermedades de las plantas, ya que es eficiente, de bajo costo para el productor, beneficiosa para los seres humanos y el medio ambiente, los programas de mejoramiento de cítricos buscan aumentar la productividad mediante el uso de estrategias de control de enfermedades genéticas. . Durante el desarrollo de nuevas variedades, los mejoradores han incorporado la selección asistida por marcadores en la detección de genes asociados con la resistencia a enfermedades. Un nuevo y eficaz sistema de marcadores moleculares, el TRAP (polimorfismo de amplificación de la región diana) basado en PCR, utiliza herramientas bioinformáticas e información de la base de datos ESTS para generar marcadores polimórficos en torno a posibles secuencias de genes candidatos. En este sentido, la base de datos del genoma expresado en cítricos más grande del mundo, CitEST, generada en Brasil, representa una poderosa herramienta para ayudar al programa de mejoramiento de cítricos, ya que ha expresado genes de todas las especies consideradas cítricos (] 1 especie) bajo genotipos contrastantes y condiciones, como resistente frente a susceptible, inducida frente a no inducida por patógenos. En este contexto, este trabajo describe la identificación de marcadores TRAP amplificados por cebadores fijos, diseñados y a partir de genes asociados a resistencia a CTV (citrus sadness virus), utilizando ADN de individuos de la progenie F 1 del cruce entre Poncirus trifoliata y Tangerine Sunki (Citrus sunkz'), progenitores resistentes y susceptibles a enfermedades, respectivamente. De un total de 8 combinaciones de cebadores abritrárío/thixos ensayadas, 2 combinaciones mostraron polimorfismo, generando un total de 4 marcas y un número medio de marcadores por par de cebadores en el valor de 2. La prueba Chi-cuadrado, aplicada individualmente a TRAPS marcadores, reveló que el 100% de los marcadores identificados segregan en la proporción mendeliana lzl. Por tanto, estos marcadores podrían introducirse en el mapa de ligamiento de P. trijblíata. Los marcadores obtenidos también pueden ser utilizados en el genotipado de todos los individuos de la referida población Fl. |
| Keywords: | Citros PCR CitEST Marcadores moleculares Marcadores moleculares Citrus Molecular markers Citrus breeding Agrios |
| ???metadata.dc.subject.cnpq???: | Genética |
| URI: | http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/19011 |
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