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Title: Estudo in sílico da evolução molecular da subfamília mimosoideae (Fabaceae) por meio de marcadores 18S e rbcL.
Other Titles: In silico study of the molecular evolution of the mimosoideae subfamily (Fabaceae) using 18S and rbcL markers.
???metadata.dc.creator???: SOUZA, Tássia Laicya Vieira de.
???metadata.dc.contributor.advisor1???: SOARES, Carlos Eduardo.
???metadata.dc.contributor.referee1???: MELO, Márcia Almeida de.
???metadata.dc.contributor.referee2???: SOUSA, Jair Moises de.
Keywords: Filogenia;Fabaceas;Marcadore moleculare 18S;Marcador molecular rbcL;Genética vegetal;Phylogeny;Fabaceae;18S molecular markers;rbcL molecular marker;Plant genetics
Issue Date: 2011
Publisher: Universidade Federal de Campina Grande
Citation: SOUZA, Tássia Laicya Vieira de. Estudo in sílico da evolução molecular da subfamília mimosoideae (Fabaceae) por meio de marcadores 18S e rbcL. 2011. 44f. Trabalho de Conclusão de Curso (Monografia), Curso de Licenciatura em Ciências Biológicas, Centro de Saúde e Tecnologia Rural, Universidade Federal de Campina Grande - Patos - Paraíba - Brasil, 2011. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/26736
???metadata.dc.description.resumo???: Sequências parciais da região do DNA ribossômico (rDNA) 18S (total 7) e do gene rbcL (total 19) de diferentes representantes da subfamília Mimosoideae (Fabaceae) foram obtidos do GenBank e empregadas neste trabalho com o objetivo de auxiliar no esclarecimento filogenético dentro desta subfamília. Alinhamentos múltiplos das sequências foram produzidos com o programa ClustalX. Para construção de árvores filogenéticas o programa MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analy sis), foi utilizado com os métodos de Neighbor-Joining (NJ) com 500 replicações e Máxima Parcimônia (MP) com 100 replicações. A árvore construída através do método NJ para o marcador 18S, apresentou uma melhor resolução filogenética agrupando as espécies dentro das suas respectivas tribos, de acordo com a classificação da ferramenta Taxonomy do NCBI. No entanto ocorreu irresoluções a nível de tribo para as topologias dadas pelos métodos NJ e MP com o marcador rbcL, em que as tribos Mimoseae e Acacieae não se mostraram monofiléticas. O gênero Albiz ia se mostrou parafilético em todas as topologias dadas pelos métodos NJ e MP baseada tanto em sequências de 18S como em sequências de rbcL. A história evolutiva das tribos de Mimosoideae baseada em sequências do gene rbcL não está de acordo com as topologias disponível no Taxonomy do NCBI.
Abstract: Partial sequences o f the region o f ribosomal DNA (rDNA) 18S (total 7) and the rbcL gene (total 19) o f different species o f the Mimosoideae subfamily were obtained from GenBank. The goal o f this work was to help in the phylogenetic inference inside this subfamily. Multiple alignments o f all sequences were produced with the ClustalX program. For construction o f phylogenetic trees the MEGA package (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) was used. The methods o f Neighbor-Joining (NJ) with 500 replications and Maximum Parsimony (MP) with 100 replications were performed. The phylogenetic tree constructed by NJ and MP methods using 18S gene showed a better resolution phylogenetic grouping species within their respective tribes, according to the classification o f the NCBI Taxonomy tool. However, at the levei o f tribe for the topologies given by NJ and MP methods with marker rbcL, unresolved clades were observed. The tribes Mimoseae and Acacieae were polyphyletic. The genus A lb izia was paraphyletic in all topologies constructed by MP and NJ methods. In this case, both topologies based on 18S and rbcL sequences do not supported the monophyletic hypostesis. In conclusion, the evolutionary history o f the Mimosoideae tribes hypothesized with rbcL gene sequences do not agree with the topologies available in the NCBI Taxonomy.
Keywords: Filogenia
Fabaceas
Marcadore moleculare 18S
Marcador molecular rbcL
Genética vegetal
Phylogeny
Fabaceae
18S molecular markers
rbcL molecular marker
Plant genetics
???metadata.dc.subject.cnpq???: Ciências Biológicas
URI: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/26736
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