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http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/27122| Title: | Simulação e avaliação de ancoramento molecular do Metabólitoazadiractina à Proteína Hidrofolato Redutase. |
| Other Titles: | Molecular docking simulation and evaluation of the Azadirachtin Metabolite to Protein Hydrofolate Reductase. Simulación de acoplamiento molecular y evaluación de la Metabolito de azadiractina a proteína hidrofolato reductasa. |
| ???metadata.dc.creator???: | FIGUEIREDO, Melquisedeque Lucena. |
| ???metadata.dc.contributor.advisor1???: | CAMPOS, Magnólia de Araújo. |
| ???metadata.dc.contributor.referee1???: | LOPES, Marcus José Conceição. |
| ???metadata.dc.contributor.referee2???: | MAIA, Rafael Trindade. |
| Keywords: | Doenças infecciosas.;Candida.;Infecções oportunistas.;Candida Albicans.;Biologia computacional.;Ancoramento molecular.;Metabóllitoazadiractina.;Infectious diseases;Opportunistic infections;Metabolitoazadirachtin;Molecular anchoring;Computational biology;Enfermedades infecciosas;Anclaje molecular |
| Issue Date: | 26-Jul-2022 |
| Publisher: | Universidade Federal de Campina Grande |
| Citation: | FIGUEIREDO, Melquisedeque Lucena. Simulação e avaliação de ancoramento molecular do Metabólitoazadiractina à Proteína Hidrofolato Redutase. 2022. 43 fl. (Trabalho de Conclusão de Curso – Monografia), Curso de Licenciatura em Ciências Biológicas, Centro de Educação e Saúde, Universidade Federal de Campina Grande, Cuité – Paraíba – Brasil, 2022. |
| ???metadata.dc.description.resumo???: | O gênero Candida constitui o principal grupo de leveduras que causam infecções oportunistas nos seres humanos, possuindo cerca de 200 espécies distintas. Diante disso, o uso da biologia computacional e as aplicações de suas ferramentas são indispensáveis para o avanço na produção de novos fármacos com maior eficácia e com tempo e valor reduzidos. A inibição do metabolismo do folato é uma importante estratégia no tratamento de doenças infecciosas. Na via metabólica do folato, a enzima diidrofolato redutase (DHFR) catalisa a redução do diidrofolato a tetraidrofolato. Este metabólito é essencial para a biossíntese de DNA e proteínas. Portanto, o desenvolvimento de novos antagonistas da diidrofolato redutase tem sido considerado como uma boa estratégia para melhorar o tratamento das doenças infecciosas. Nessa perspectiva, o presente trabalho teve por objetivo analisar a ancoragem molecular da proteína diidrofolato redutase de Candida albicans com o ligante azadiractina a fim de estudar seu potencial inibitório frente a tal proteína, explorando uma possível nova interação ou alvo molecular específico. Deste modo, foram realizados experimentos in silico de docking proteína-ligante no programa Autodock 4.61, resultando numa interação direta da azadiractina com o sítio ativo da DHFR, os dados estimados nos cálculos revelaram valores expressivamente negativos, para a energia livre de ligação variaram de -1.21 kcal/mol, no complexo 1, a -1.45 kcal/mol, no complexo 10, enquanto que para a energia intermolecular variaram de -5.08 a -9.43. Em sequência, as constantes de inibição (KI) variaram de 80,35 uM a 894,54 μM. Sendo a azadiractina um inibidor fraco devido aos valores de KI, mesmo se ligando diretamente ao sitio ativo da proteína. |
| Abstract: | The Candida genus is the main group of yeasts that cause opportunistic infections in human beings, with around 200 different species. Facing this, the use of computational biology and the application of its tools are indispensable to the advance on the production of new drugs with higher efficiency and reduced demanded time and value. The inhibition of the folate metabolism is an important strategy on treatments of infectious diseases. On the metabolic pathway of folate, the enzyme dihydrofolate reductase (DHFR) catalyzes the reduction of dihydrofolate into tetrahydrofolate. This metabolite is essential to the biosynthesis of DNA and proteins. Therefore, the development of new antagonist of dihydrofolate reductase have been considered a good strategy to optimize the treatment of infectious diseases. On this perspective, the present work aimed to analyze the molecular anchoring of the protein dihydrofolate reductase of Candida albicans with the ligand azadiractine in order to study its inhibitory potential facing said protein, exploring a possible new interaction or specific molecular target. On this wise, in silico protein- ligand experiments were done on Autodock 4.6, resulting in a direct interaction of Azadiractine with the active site of DHFR. The estimated data in the calculations revealed expressively negative values, for the free energy of binding, they ranged from -1.21 kcal/mol, on complex 1, to -1.45 kcal/mol, on complex 10, while for the intermolecular energy they ranged from -5.08 to -9.43. In sequence, the inhibition constants (KI) ranged from 80,35 uM to 894,54 μM. Azadirachtin is a weak inhibitor due to KI values, even if it binds directly to the active site of the protein. |
| ???metadata.dc.description.resumen???: | El género Candida constituye el principal grupo de levaduras causantes de infecciones oportunistas. en humanos, teniendo alrededor de 200 especies distintas. Por lo tanto, el uso de la biología computacional y las aplicaciones de sus herramientas son indispensables para el avance en la producción de nuevos fármacos con mayor eficacia y con menor tiempo y valor. La inhibición del metabolismo de folato es una estrategia importante en el tratamiento de enfermedades infecciosas. En la vía metabólica de folato, la enzima dihidrofolato reductasa (DHFR) cataliza la reducción de dihidrofolato a tetrahidrofolato. Este metabolito es esencial para la biosíntesis de ADN y proteínas. Por lo tanto, el desarrollo de nuevos antagonistas de la dihidrofolato reductasa se ha considerado una buena estrategia para mejorar el tratamiento de las enfermedades infecciosas. Desde esta perspectiva, el presente trabajo tuvo analizar el anclaje molecular de la proteína dihidrofolato reductasa de Candida albicans con el ligando azadiractina para estudiar su potencial inhibidor frente a esta proteína, explorar una posible nueva interacción o un objetivo molecular específico. De esta forma, fueron llevado a cabo in silico proteína-ligando acoplamiento experimentos en el programa Autodock 4.61, resultando en una interacción directa de azadiractina con el sitio activo de DHFR, los datos estimados en los cálculos revelaron valores significativamente negativos para la energía libre de enlace osciló entre -1,21 kcal/mol, en el complejo 1, y -1,45 kcal/mol, en el complejo 10, mientras que para la energía intermolecular osciló entre -5,08 y -9,43. En secuencia, las constantes de inhibición (KI) osciló entre 80,35 µM y 894,54 µM. Dado que la azadiractina es un inhibidor débil debido a la de KI, incluso uniéndose directamente al sitio activo de la proteína. |
| Keywords: | Doenças infecciosas. Candida. Infecções oportunistas. Candida Albicans. Biologia computacional. Ancoramento molecular. Metabóllitoazadiractina. Infectious diseases Opportunistic infections Metabolitoazadirachtin Molecular anchoring Computational biology Enfermedades infecciosas Anclaje molecular |
| ???metadata.dc.subject.cnpq???: | Doenças Infecciosas e Parasitárias |
| URI: | http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/27122 |
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| MELQUISEDEQUE LUCENA FIGUEIREDO - TCC LICENCIATURA EM CIÊNCIAS BIOLÓGICAS CES 2022.pdf | Melquisedeque Lucena Figueiredo - TCC Licenciatura em Ciências Biológicas CES 2022 | 687.08 kB | Adobe PDF | View/Open |
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