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Title: Avaliação do uso de inteligência artificial aplicada à mineração de dados termodinâmicos de proteínas.
Other Titles: Evaluation of the use of artificial intelligence applied to protein thermodynamic data mining.
???metadata.dc.creator???: SILVA, Alisson Clementino da.
???metadata.dc.contributor.advisor1???: NUNES, Bruno Rafael Pereira.
???metadata.dc.contributor.advisor2???: XAVIER, Joycimara Santos.
???metadata.dc.contributor.referee1???: MOREIRA, Bruna.
???metadata.dc.contributor.referee2???: REGO, Thaís Gaudêncio do.
???metadata.dc.contributor.referee3???: MAIA, Rafael Trindade.
Keywords: Mineração de dados;Inteligência artificial;Aprendizado de máquina;Termodinâmica de proteínas – dados;Curadoria de dados;ThermoMutDB – base de dados;Data mining;Artificial intelligence;Machine learning;Protein thermodynamics – data;Data curation;ThermoMutDB – database
Issue Date: 10-Jul-2023
Publisher: Universidade Federal de Campina Grande
Citation: SILVA, Alisson Clementino da. Avaliação do uso de inteligência artificial aplicada à mineração de dados termodinâmicos de proteínas. 2023. 55f. Trabalho de Conclusão de Curso (Monografia), Curso de Engenharia de Biotecnologia e Bioprocessos, Centro de Desenvolvimento Sustentável do Semiárido, Universidade Federal de Campina Grande - Sumé - Paraíba - Brasil, 2023. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/31316
???metadata.dc.description.resumo???: O alinhamento da biotecnologia moderna com a bioinformática tem fornecido importantes informações para a descoberta e o desenvolvimento de novos fármacos. A realização de estudos de mutagênese, a partir de abordagens computacionais, tem tentado prever os efeitos de mutações missense em proteínas, que estão relacionadas a doenças graves, por meio de suas estruturas tridimensionais. Para tal feito, preditores computacionais de estabilidade, que avaliam os efeitos da mutação, precisam de um grande volume de dados termodinâmicos para serem capazes de predizer os efeitos estruturais causados à proteína. Um dos problemas recorrentes é a falta de estruturação e padronização dos dados utilizados, que demanda muito tempo de trabalho humano para solucionar. Sendo assim, a utilização de inteligência artificial torna possível a mineração e gerenciamento de dados em menor tempo, auxiliando o processo de design de novos fármacos. Esta pesquisa apresenta o treinamento de um modelo de machine learning, na plataforma LitSuggest, para recuperação de referências que contenham dados termodinâmicos de proteínas, depositadas no repositório PubMed. Um total de 14 referências foram classificadas pelo modelo e selecionadas em curadoria manual, totalizando 283 novas mutações e 2.901 novos dados adicionados no ThermoMutDB.
Abstract: The alignment of modern biotechnology with bioinformatics has provided important information for the discovery and development of new drugs. Mutagenesis studies from computational approaches have attempted to predict the effects of missense mutations on proteins that are related to serious diseases through their three-dimensional structures. For this purpose, computational stability predictors which evaluate the effects of mutation need a large volume of thermodynamic data to be able to predict the structural effects caused to the protein. One of the recurring problems is the lack of structuring and standardization of the data used, which takes a lot of human time to solve. Thus, the use of artificial intelligence makes data mining and management possible in less time, assisting in the design process of new drugs. This research presents the training of a machine learning model, on the LitSuggest platform, to retrieve references containing thermodynamic data of proteins, deposited in the PubMed repository. A total of 14 references were classified by the model and selected in manual curation, totaling 283 new mutations and 2,901 new data added to ThermoMutDB.
Keywords: Mineração de dados
Inteligência artificial
Aprendizado de máquina
Termodinâmica de proteínas – dados
Curadoria de dados
ThermoMutDB – base de dados
Data mining
Artificial intelligence
Machine learning
Protein thermodynamics – data
Data curation
ThermoMutDB – database
???metadata.dc.subject.cnpq???: Engenharia de Biotecnologia e Bioprocessos
URI: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/31316
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