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Title: Análise in silico do gene LYS2 para identificação de fusarium Oxysporum f. sp. rapae.
Other Titles: In silico analysis of the LYS2 gene for identification of fusarium Oxysporum f. sp. rapae.
???metadata.dc.creator???: SILVA, Pedro Victor da.
NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do.
Keywords: Batata doce;Primers;Kit diagnóstico;Gene LYS2;Fusarium Oxysporum f. sp. rapae;Sweet potato;Diagnostic kit;LYS2 gene;Fusarium Oxysporum f. sp. rapae
Issue Date: 2024
Publisher: Universidade Federal de Campina Grande
Citation: SILVA, Pedro Victor da; NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do. Análise in sílico do gene LYS2 para identificação de Fusarium Oxysporum f. sp. rapae. REVISTA FISIO&TERAPIA, v. 28, p. 65, 2024. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/36188
???metadata.dc.description.resumo???: A batata-doce (Ipomoea batatas (L) Lam.) é uma hortaliça de importância nacional, uma vez que é a quarta hortaliça mais consumida no Brasil com grande adaptação aos diversos sistemas de climas e solos, possuindo baixo custo de produção. Nacionalmente, as regiões Sul e Nordeste destacam-se por serem responsáveis por grande parte da produção do país. Contudo, perdas signi{cativas na produção têm sido observadas decorrente da as infeções de patógenos fúngicos, em destaque a espécie Fusarium Oxysporum. Dessa forma,o presente trabalho teve por objetivo fazer um estudo in sílico do gene LYS2 Fusarium Oxysporum f. sp. rapae com o intuito de obter possível oligonucleotídeos especi{co para kit de diagnóstico molecular. As buscas das sequências gênicas foram realizadas utilizando a plataforma da plataforma do NCBI e ferramenta blast foram selecionadas 15 sequencias para em seguida gerar a árvore {logenética com as sequencias selecionadas e depois desenhar os marcadores para qPCR. Os resultados obtidos da arvore {logenética, com o método de inferência bootstrap, apresentaram bons resultados de similaridades entre as espécies. Os oligonucleotídeos desenhados com a plataforma primer3Plus demonstraram serem bons marcadores para diagnosticar o F. oxysporum na batata doce, sendo um protocolo para técnica qPCR.
Keywords: Batata doce
Primers
Kit diagnóstico
Gene LYS2
Fusarium Oxysporum f. sp. rapae
Sweet potato
Diagnostic kit
LYS2 gene
Fusarium Oxysporum f. sp. rapae
???metadata.dc.subject.cnpq???: Genética Vegetal.
URI: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/36188
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ANÁLISE IN SÍLICO DO GENE LYS2PARAIDENTIFICAÇÃO DE FUSARIUMOXYSPORUMF. SP. RAPAE - ARTIGO DE PERIÓDICO CDSA 2024.pdfAnálise in silico do gene LYS2 para identificação de fusarium Oxysporum f. sp. rapae - Artigo de Periódico CDSA 2024.285.59 kBAdobe PDFView/Open


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