dc.creator.ID |
RODRIGUES. M. A. |
pt_BR |
dc.contributor.advisor1 |
MASSONI, Tiago Lima. |
|
dc.contributor.advisor1ID |
MASSONI, T. L. |
pt_BR |
dc.contributor.advisor1Lattes |
http://lattes.cnpq.br/3563923906851611 |
pt_BR |
dc.contributor.referee1 |
MACHADO, Patrícia Duarte de Lima. |
|
dc.contributor.referee1ID |
MACHADO, P. D. L. |
pt_BR |
dc.contributor.referee1Lattes |
http://lattes.cnpq.br/2495918356675019 |
pt_BR |
dc.contributor.referee2 |
BRASILEIRO, Francisco Vilar. |
|
dc.contributor.referee2ID |
BRASILEIRO, F. V. |
pt_BR |
dc.contributor.referee2Lattes |
http://lattes.cnpq.br/5957855817378897 |
pt_BR |
dc.description.resumo |
Aplicamos PCA, t-SNE e UMAP nos datasets de calculadoras de interpretação genética com dados de grupos
étnicos judaicos, de vários vizinhos não-judeus e de etnias correlacionadas, utilizando o software R. Realizamos
uma comparação visual entre os resultados gerados e utilizamos o microbenchmark para verificar o tempo de
execução dos métodos. O t-SNE e o UMAP são eficientes para trabalharmos com âmbitos locais da visualização,
enquanto o PCA é adequado quando o número de amostras é reduzido. t-SNE e UMAP são capazes de formar
agrupamentos que não veríamos somente utilizando o PCA. Apesar disso, são mais lentos que o PCA, e as
visualizações geradas por eles mudam ao executar o algoritmo novamente. |
pt_BR |
dc.publisher.country |
Brasil |
pt_BR |
dc.publisher.department |
Centro de Engenharia Elétrica e Informática - CEEI |
pt_BR |
dc.publisher.initials |
UFCG |
pt_BR |
dc.subject.cnpq |
Ciência da Computação. |
pt_BR |
dc.title |
Explorando técnicas de redução de dimensionalidade na análise de DNA de grupos judaicos e de outros grupos étnicos: uma comparação entre PCA, t-SNE e UMAP. |
pt_BR |
dc.date.issued |
2023-06-28 |
|
dc.description.abstract |
We applied PCA, t-SNE, and UMAP to datasets from genetic interpretation calculators containing data of Jewish
ethnic groups, various non-Jewish neighbors, and correlated ethnicities, using the R software. We conducted a
visual comparison of the generated results and used microbenchmarking to measure the execution time of the
methods. t-SNE and UMAP are efficient for working with local aspects of visualization, while PCA is suitable when
the number of samples is small. t-SNE and UMAP are capable of forming clusters that would not be seen using
PCA alone. However, they are slower than PCA, and the visualizations generated by them change when the
algorithm is run again. |
pt_BR |
dc.identifier.uri |
http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/30521 |
|
dc.date.accessioned |
2023-07-03T14:57:50Z |
|
dc.date.available |
2023-07-03 |
|
dc.date.available |
2023-07-03T14:57:50Z |
|
dc.type |
Trabalho de Conclusão de Curso |
pt_BR |
dc.subject |
Etnias |
pt_BR |
dc.subject |
Judeus |
pt_BR |
dc.subject |
DNA |
pt_BR |
dc.subject |
t-SNE |
pt_BR |
dc.subject |
UMAP |
pt_BR |
dc.subject |
Redução de dimensionalidade |
pt_BR |
dc.subject |
Calculadoras de interpretação genética |
pt_BR |
dc.subject |
Grupos étnicos |
pt_BR |
dc.subject |
Software R. |
pt_BR |
dc.subject |
Microbanchmark |
pt_BR |
dc.subject |
PCA |
pt_BR |
dc.subject |
Ethnicities |
pt_BR |
dc.subject |
Jews |
pt_BR |
dc.subject |
Dimensionality reduction |
pt_BR |
dc.subject |
Genetic Interpretation Calculators |
pt_BR |
dc.subject |
Ethnic groups |
pt_BR |
dc.subject |
R software. |
pt_BR |
dc.subject |
Microbankmark |
pt_BR |
dc.rights |
Acesso Aberto |
pt_BR |
dc.creator |
RODRIGUES, Matheus Andrade. |
|
dc.publisher |
Universidade Federal de Campina Grande |
pt_BR |
dc.language |
por |
pt_BR |
dc.title.alternative |
Exploring dimensionality reduction techniques in DNA analysis of jewish and other ethnic groups: a comparison of PCA, T-SNE, AND UMAP. |
pt_BR |
dc.identifier.citation |
RODRIGUES, Matheus Andrade. Explorando técnicas de redução de dimensionalidade na análise de DNA de grupos judaicos e de outros grupos étnicos: uma comparação entre PCA, t-SNE e UMAP. 2023. 24f. (Trabalho de Conclusão de Curso - Artigo), Curso de Bacharelado em Ciência da Computação, Centro de Engenharia Elétrica e Informática, Universidade Federal de Campina Grande – Paraíba - Brasil, 2023. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/30521 |
pt_BR |