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Análise in silico do gene LYS2 para identificação de fusarium Oxysporum f. sp. rapae.

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dc.description.resumo A batata-doce (Ipomoea batatas (L) Lam.) é uma hortaliça de importância nacional, uma vez que é a quarta hortaliça mais consumida no Brasil com grande adaptação aos diversos sistemas de climas e solos, possuindo baixo custo de produção. Nacionalmente, as regiões Sul e Nordeste destacam-se por serem responsáveis por grande parte da produção do país. Contudo, perdas signi{cativas na produção têm sido observadas decorrente da as infeções de patógenos fúngicos, em destaque a espécie Fusarium Oxysporum. Dessa forma,o presente trabalho teve por objetivo fazer um estudo in sílico do gene LYS2 Fusarium Oxysporum f. sp. rapae com o intuito de obter possível oligonucleotídeos especi{co para kit de diagnóstico molecular. As buscas das sequências gênicas foram realizadas utilizando a plataforma da plataforma do NCBI e ferramenta blast foram selecionadas 15 sequencias para em seguida gerar a árvore {logenética com as sequencias selecionadas e depois desenhar os marcadores para qPCR. Os resultados obtidos da arvore {logenética, com o método de inferência bootstrap, apresentaram bons resultados de similaridades entre as espécies. Os oligonucleotídeos desenhados com a plataforma primer3Plus demonstraram serem bons marcadores para diagnosticar o F. oxysporum na batata doce, sendo um protocolo para técnica qPCR. pt_BR
dc.publisher.country Brasil pt_BR
dc.publisher.initials UFCG pt_BR
dc.subject.cnpq Genética Vegetal. pt_BR
dc.citation.volume 28 pt_BR
dc.title Análise in silico do gene LYS2 para identificação de fusarium Oxysporum f. sp. rapae. pt_BR
dc.date.issued 2024
dc.identifier.uri http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/36188
dc.date.accessioned 2024-06-19T18:26:06Z
dc.date.available 2024-06-19
dc.date.available 2024-06-19T18:26:06Z
dc.type Artigo de Periódico pt_BR
dc.subject Batata doce pt_BR
dc.subject Primers pt_BR
dc.subject Kit diagnóstico pt_BR
dc.subject Gene LYS2 pt_BR
dc.subject Fusarium Oxysporum f. sp. rapae pt_BR
dc.subject Sweet potato pt_BR
dc.subject Diagnostic kit pt_BR
dc.subject LYS2 gene pt_BR
dc.subject Fusarium Oxysporum f. sp. rapae pt_BR
dc.rights Acesso Aberto pt_BR
dc.creator SILVA, Pedro Victor da.
dc.creator NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do.
dc.publisher Universidade Federal de Campina Grande pt_BR
dc.language por pt_BR
dc.title.alternative In silico analysis of the LYS2 gene for identification of fusarium Oxysporum f. sp. rapae. pt_BR
dc.identifier.citation SILVA, Pedro Victor da; NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do. Análise in sílico do gene LYS2 para identificação de Fusarium Oxysporum f. sp. rapae. REVISTA FISIO&TERAPIA, v. 28, p. 65, 2024. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/36188 pt_BR


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